В России создана Национальная база данных геномных последовательностей (мутаций) вируса SARS-CoV-2
Разработчиком этой программы и консолидирующим центром стал Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.
«До сих пор информация о мутациях (геномных последовательностях) вируса SARS-CoV-2 из России была разрозненной, что в условиях продолжающейся пандемии, безусловно, является тормозящим фактором в борьбе новой коронавирусной инфекцией», — говорится в сообщении, опубликованном на сайте Роспотребнадзора.
Теперь же создана и введена в действие платформа «VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). Она включает в себя базу данных и програмное обеспечение, что позволяет сортировать, характеризовать и анализировать данные о мутациях вируса и его распространённости в тех или иных регионах России.
Сервис RuStrain» поможет анализировать результаты секвенирования (прочтения генов), определять штамм вируса и загружать образцы, предназначенные для дальнейшего секвенирования.
Кроме того, данная платформа при необходимости может быть использована как база для мониторинга за другими инфекциями.
Глава Роспотребнадзора Анна Попова ранее сообщала, что сейчас в мире самым распространенным является индийский штамм коронавируса
«На сегодня Всемирная организация здравоохранения выделяет значимых четыре штамма. Это британский, южноафриканский, бразильский и индийский. Самое интенсивное распространение на сегодня получил последний. Эту мутацию коронавируса уже выявили в 64 странах», — уточнила она.
Глава Роспотребнадзора сказала также, что в России также началось интенсивное распространение индийского штамма
Также она добавила, что «значимые титры, которые формируются после вакцинации, способны защитить от всех четырех штаммов».
При этом специалист считает: скачок заболеваемости коронавирусом в России связан с несколькими факторами. Это «нигилизм тотальный» по отношению к защитным мерам, миграция граждан весной и в начале лета, а также недостаточный уровень вакцинации в России.
По данным платформа GISAID, которая выкладывает в открытый доступ геномные данные вирусов гриппа и коронавируса, доля индийского штамма в России за последние четыре недели превысила 70%
Но надо учитывать, что в России делается очень мало анализов генома (секвентирование).
По данным того же GISAID за весь период пандемии на территории страны отобрали и секвенировали 273 образца дельта-варианта, впервые обнаруженного в Индии в октябре прошлого года. Из них 187 образцов отобрали в течение последних четырех недель.
Мэр Москвы Сергей Собянин заявил, что в Москве сейчас почти нет оригинальной версии коронавируса - пришла новая, более агрессивная мутация, которая усложняет эпидемическую ситуацию
«К сожалению, то, с чем мы боролись в прошлом году, с китайским вирусом — уханьским, сегодня его в Москве практически нет; пришла новая мутация, новый штамм действует. Он более агрессивный, более тяжело переносится, быстрее распространяется. Пробивает значительно больше иммунитет человека», — сказал Собянин.
Главный врач больницы в Коммунарке Денис Проценко сообщил, что коронавирус сильно изменился — теперь врачи наблдюают «болезнь с новыми сценариями». Сейчас для COVID-19 характерен более короткий инкубационный период — четыре-пять дней вместо семи-девяти ранее, появились больные, которые не реагируют на стандартные приёмы лечения осложнений коронавируса. Впрочем, врач не связывает произошедшие с коронавирусом изменения и рост заболеваемости в России с индийским штаммом SARS-CoV-2.
Эксперты консорциума CoRGI (Коронавирусная российская генетическая инициатива, занимается исследованием геномов SARS-CoV-2) считают, что на рост числа заболевших влияют не только медленные темпы вакцинации и отказ многих граждан от соблюдения ограничений, но и распространение новых штаммов, в том числе индийского варианта. Эксперты CoRGI утверждают, что со второй половины апреля, когда индийский штамм попал в Россию, он начал вытеснять другие варианты.
Фото Pexels
17.06.2021 г.